En ekonom och en framgångsrik företagare försvinner. Kriminalinspektör Ellinor Sandin misstänker kidnappning. Hon och hennes chef Lars Bergquist tar upp jakten på okända gärningsmän. Men tiden rinner iväg. Blodröd höst är den andra delen i Margaretha Levin Blekastads kriminalserie som utspelas i och omkring Uppsala.
